生徒の自主性を大切にする跡見学園では、生徒会活動が活発です。執行部である総務局を中心に、学校生活をよりよいものにするため、生徒の声を取り入れながら活動しています。総務局は生徒会長をはじめ、副会長や各学年の代表、各委員会の長などで構成されています。生徒会長と学年代表は生徒の投票によって選出されます。生徒会は、各委員会での定例の話し合いから、学園祭やスポーツ大会といった行事の企画・運営・実施、生徒会誌の発行まで幅広く活動しています。学園祭を訪れた小学生たちに校内を案内する「小学生探検隊」は、生徒会が主体となってはじめたもので、生徒会の伝統となりつつあります。

ホーム・ルームは生徒会活動の最も基本的な単位として活動する。

学年委員会はその学年に共通する事項について活動する。議長は学年代表が兼任する。

代表委員会は全会員の意志を反映して議決を行う機関であり、生徒会に関する全ての事項を審議し決定する。

総会は、全会員で構成する最高議決機関であり、代表委員会における決定事項の中で次にかかげるものについて議決を行う。

1. 決算
2. 監査報告
3. 会長の任命による副会長、庶務部長、生活向上部長、報道部長の承認
4. 会長の罷免
5. 会則の改正
6. その他代表委員会において総会の議決を必要と認めた事項

総務局は会長を中心として生徒会全般の運営を計り次の業務を行う。

1. 各部会、各委員会が議決した事項及び計画の連絡または調整
2. 総会及び代表委員会の議題の作成
3. 生徒会全般の年間計画の作成

各部の業務は次の通りとする。

1. 庶務部
   会員相互の理解と親睦に関する事項及びその他各部に属さない、いっさいの事項
2. 生活向上部
   学園生活が円滑に営まれるように会員と密接した風紀、保健等に関する事項
3. 報道部
   生徒会報道（広報紙、放送、掲示等）に関する事項

クラブ委員会の一般業務はクラブ関係の事項を審議し、クラブ間の調整をはかり必要事項を代表委員会に提出する。

実行委員会は生徒会行事または特別な事項を企画、立案し執行する。実行委員会は常設委員会と特別委員会があり常設委員会は次の通りとする。

1. 学園祭実行委員会
2. 生徒会誌実行委員会
3. 歓送迎実行委員会

監査内容は次の通りとする。

1. 生徒会会計の全般に関すること
2. 生徒会会則の運用に関すること
3. 総会、各委員会、各部会、各クラブの決定事項の運用に関すること
4. 会長、各委員長の会則に基づく運営に関すること

選挙管理委員会は会長および学年代表選挙に関する一切の業務を管理し執行する。

会計委員会は次の業務を行う。

1. 生徒会に関する一切の会計業務
2. 特別会計予算案の作成
3. 翌年度の一般会計予算案の作成